MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Helicobacter pylori 83 chromosome

Total Repeats: 30746

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017375	GAGC	2	8	30	37	25 %	0 %	50 %	25 %	385224643
2	NC_017375	CATT	2	8	116	123	25 %	50 %	0 %	25 %	385224643
3	NC_017375	GAT	3	9	124	132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385224643
4	NC_017375	T	6	6	261	266	0 %	100 %	0 %	0 %	385224643
5	NC_017375	AAGC	2	8	297	304	50 %	0 %	25 %	25 %	385224643
6	NC_017375	T	7	7	320	326	0 %	100 %	0 %	0 %	385224643
7	NC_017375	T	7	7	348	354	0 %	100 %	0 %	0 %	385224643
8	NC_017375	TTC	2	6	358	363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385224643
9	NC_017375	ACA	2	6	384	389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385224643
10	NC_017375	ACC	2	6	395	400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385224643
11	NC_017375	C	6	6	402	407	0 %	0 %	0 %	100 %	385224643
12	NC_017375	AAT	2	6	459	464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385224644
13	NC_017375	C	6	6	644	649	0 %	0 %	0 %	100 %	385224644
14	NC_017375	AAC	2	6	699	704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385224644
15	NC_017375	CT	3	6	705	710	0 %	50 %	0 %	50 %	385224644
16	NC_017375	CTT	2	6	802	807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385224644
17	NC_017375	TCTG	2	8	812	819	0 %	50 %	25 %	25 %	385224644
18	NC_017375	TGA	2	6	820	825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385224644
19	NC_017375	TTGCAA	2	12	869	880	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385224644
20	NC_017375	AAAT	2	8	914	921	75 %	25 %	0 %	0 %	385224645
21	NC_017375	CTA	2	6	943	948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385224645
22	NC_017375	AAC	2	6	1026	1031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385224645
23	NC_017375	CCGCAG	2	12	1045	1056	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	385224645
24	NC_017375	CCA	2	6	1189	1194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385224645
25	NC_017375	GCT	2	6	1214	1219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385224645
26	NC_017375	CA	3	6	1228	1233	50 %	0 %	0 %	50 %	385224645
27	NC_017375	T	6	6	1245	1250	0 %	100 %	0 %	0 %	385224645
28	NC_017375	TC	3	6	1287	1292	0 %	50 %	0 %	50 %	385224645
29	NC_017375	T	6	6	1349	1354	0 %	100 %	0 %	0 %	385224645
30	NC_017375	GGC	2	6	1405	1410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385224645
31	NC_017375	GCTT	2	8	1457	1464	0 %	50 %	25 %	25 %	385224645
32	NC_017375	CT	3	6	1563	1568	0 %	50 %	0 %	50 %	385224645
33	NC_017375	TAAAA	2	10	1603	1612	80 %	20 %	0 %	0 %	385224645
34	NC_017375	GTT	2	6	1625	1630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385224645
35	NC_017375	TAG	2	6	1648	1653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385224645
36	NC_017375	CTT	2	6	1659	1664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385224645
37	NC_017375	TTC	2	6	1764	1769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385224646
38	NC_017375	A	7	7	1779	1785	100 %	0 %	0 %	0 %	385224646
39	NC_017375	ATTATA	2	12	1797	1808	50 %	50 %	0 %	0 %	385224646
40	NC_017375	CCTG	2	8	1812	1819	0 %	25 %	25 %	50 %	385224646
41	NC_017375	ATG	2	6	1825	1830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385224646
42	NC_017375	CCAA	2	8	1836	1843	50 %	0 %	0 %	50 %	385224646
43	NC_017375	TGAA	2	8	1876	1883	50 %	25 %	25 %	0 %	385224646
44	NC_017375	GTT	2	6	1899	1904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385224646
45	NC_017375	T	6	6	1978	1983	0 %	100 %	0 %	0 %	385224646
46	NC_017375	TTC	2	6	1986	1991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385224646
47	NC_017375	ATT	2	6	2055	2060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385224646
48	NC_017375	AATG	2	8	2066	2073	50 %	25 %	25 %	0 %	385224646
49	NC_017375	AAT	2	6	2106	2111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385224646
50	NC_017375	TAG	2	6	2159	2164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385224646
51	NC_017375	AGG	2	6	2190	2195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385224646
52	NC_017375	GATTA	2	10	2250	2259	40 %	40 %	20 %	0 %	385224646
53	NC_017375	A	8	8	2544	2551	100 %	0 %	0 %	0 %	385224647
54	NC_017375	TCTT	2	8	2560	2567	0 %	75 %	0 %	25 %	385224647
55	NC_017375	T	7	7	2640	2646	0 %	100 %	0 %	0 %	385224647
56	NC_017375	T	7	7	2682	2688	0 %	100 %	0 %	0 %	385224647
57	NC_017375	TGC	2	6	2728	2733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385224647
58	NC_017375	AGC	2	6	2780	2785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385224647
59	NC_017375	GC	3	6	2793	2798	0 %	0 %	50 %	50 %	385224647
60	NC_017375	A	6	6	2831	2836	100 %	0 %	0 %	0 %	385224647
61	NC_017375	ATTAA	2	10	2927	2936	60 %	40 %	0 %	0 %	385224647
62	NC_017375	AG	3	6	2950	2955	50 %	0 %	50 %	0 %	385224647
63	NC_017375	GTG	2	6	2969	2974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385224647
64	NC_017375	AGA	2	6	3067	3072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385224647
65	NC_017375	CAAA	2	8	3103	3110	75 %	0 %	0 %	25 %	385224647
66	NC_017375	GTA	2	6	3128	3133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385224647
67	NC_017375	GCC	2	6	3135	3140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385224647
68	NC_017375	TTG	2	6	3219	3224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385224648
69	NC_017375	GAAA	2	8	3250	3257	75 %	0 %	25 %	0 %	385224648
70	NC_017375	GAAA	2	8	3325	3332	75 %	0 %	25 %	0 %	385224648
71	NC_017375	AGTG	2	8	3346	3353	25 %	25 %	50 %	0 %	385224648
72	NC_017375	TG	3	6	3432	3437	0 %	50 %	50 %	0 %	385224648
73	NC_017375	AGC	2	6	3550	3555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385224648
74	NC_017375	GTT	2	6	3581	3586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385224648
75	NC_017375	CTA	2	6	3621	3626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385224648
76	NC_017375	ATC	2	6	3665	3670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385224648
77	NC_017375	A	6	6	3869	3874	100 %	0 %	0 %	0 %	385224648
78	NC_017375	ATT	2	6	3909	3914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385224648
79	NC_017375	GGC	2	6	3982	3987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385224648
80	NC_017375	TGT	2	6	4746	4751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385224649
81	NC_017375	A	6	6	4777	4782	100 %	0 %	0 %	0 %	385224649
82	NC_017375	ATT	2	6	4812	4817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385224649
83	NC_017375	T	6	6	4830	4835	0 %	100 %	0 %	0 %	385224649
84	NC_017375	A	6	6	4840	4845	100 %	0 %	0 %	0 %	385224649
85	NC_017375	A	6	6	4856	4861	100 %	0 %	0 %	0 %	385224649
86	NC_017375	TTTTA	2	10	4915	4924	20 %	80 %	0 %	0 %	385224650
87	NC_017375	TC	3	6	4960	4965	0 %	50 %	0 %	50 %	385224650
88	NC_017375	A	6	6	4993	4998	100 %	0 %	0 %	0 %	385224650
89	NC_017375	T	7	7	5003	5009	0 %	100 %	0 %	0 %	385224650
90	NC_017375	ACTA	2	8	5045	5052	50 %	25 %	0 %	25 %	385224650
91	NC_017375	A	6	6	5057	5062	100 %	0 %	0 %	0 %	385224650
92	NC_017375	CA	3	6	5090	5095	50 %	0 %	0 %	50 %	385224650
93	NC_017375	TCGC	2	8	5355	5362	0 %	25 %	25 %	50 %	385224651
94	NC_017375	T	6	6	5363	5368	0 %	100 %	0 %	0 %	385224651
95	NC_017375	CATT	2	8	5428	5435	25 %	50 %	0 %	25 %	385224651
96	NC_017375	ATT	2	6	5450	5455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385224651
97	NC_017375	TGG	2	6	5548	5553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385224651
98	NC_017375	A	6	6	5660	5665	100 %	0 %	0 %	0 %	385224651
99	NC_017375	C	6	6	5680	5685	0 %	0 %	0 %	100 %	385224651
100	NC_017375	A	6	6	5702	5707	100 %	0 %	0 %	0 %	385224651
101	NC_017375	GTT	2	6	5750	5755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385224651
102	NC_017375	TAA	2	6	5819	5824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385224651
103	NC_017375	GTTGA	2	10	5843	5852	20 %	40 %	40 %	0 %	385224651
104	NC_017375	TTA	2	6	5877	5882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385224651
105	NC_017375	GTG	2	6	5946	5951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385224651
106	NC_017375	GTT	2	6	5966	5971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385224651
107	NC_017375	GC	3	6	6008	6013	0 %	0 %	50 %	50 %	385224651
108	NC_017375	TGT	2	6	6067	6072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385224651
109	NC_017375	TCT	2	6	6090	6095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385224651
110	NC_017375	C	6	6	6112	6117	0 %	0 %	0 %	100 %	385224651
111	NC_017375	GTT	2	6	6122	6127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385224651
112	NC_017375	TTTGA	2	10	6221	6230	20 %	60 %	20 %	0 %	385224651
113	NC_017375	GCTTGC	2	12	6252	6263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385224651
114	NC_017375	CAG	2	6	6298	6303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385224651
115	NC_017375	CAT	2	6	6490	6495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385224651
116	NC_017375	GGTGAA	2	12	6578	6589	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	385224651
117	NC_017375	TGT	2	6	6594	6599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385224651
118	NC_017375	TGT	2	6	6604	6609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385224651
119	NC_017375	CAC	2	6	6613	6618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385224651
120	NC_017375	CCG	2	6	6669	6674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385224651
121	NC_017375	TTGC	2	8	6692	6699	0 %	50 %	25 %	25 %	385224651
122	NC_017375	CTT	2	6	6763	6768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385224651
123	NC_017375	TTG	2	6	6776	6781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385224651
124	NC_017375	TGGT	2	8	6890	6897	0 %	50 %	50 %	0 %	385224651
125	NC_017375	CCGTTC	2	12	6933	6944	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	385224651
126	NC_017375	T	6	6	7033	7038	0 %	100 %	0 %	0 %	385224651
127	NC_017375	ATCG	2	8	7073	7080	25 %	25 %	25 %	25 %	385224651
128	NC_017375	CGTT	2	8	7108	7115	0 %	50 %	25 %	25 %	385224651
129	NC_017375	TGT	2	6	7425	7430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385224652
130	NC_017375	A	15	15	7434	7448	100 %	0 %	0 %	0 %	385224652
131	NC_017375	G	6	6	7486	7491	0 %	0 %	100 %	0 %	385224652
132	NC_017375	TGT	2	6	7514	7519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385224652
133	NC_017375	CAT	2	6	7603	7608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385224653
134	NC_017375	GCC	2	6	7609	7614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385224653
135	NC_017375	TCT	2	6	7670	7675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385224653
136	NC_017375	GAAACC	2	12	7718	7729	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385224653
137	NC_017375	AAT	2	6	7768	7773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385224653
138	NC_017375	CTT	2	6	7776	7781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385224653
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